Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREM1Q9NP99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms