Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMX1Q9NP08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMX1Q9NP08 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms