Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-5Q9HDB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms