Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELL3Q9HB65 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELL3Q9HB65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms