Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms