Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7BQ9H9Q2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7BQ9H9Q2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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