Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRKRIP1Q9H875 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRKRIP1Q9H875 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRKRIP1Q9H875 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms