Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A3Q9H7F0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A3Q9H7F0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A3Q9H7F0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms