Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPF2Q9H7B2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms