Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OPA3Q9H6K4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OPA3Q9H6K4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms