Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms