Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFSD1Q9H3U5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD1Q9H3U5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms