Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms