Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG9Q9H0W8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMG9Q9H0W8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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