Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NACA2Q9H009 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NACA2Q9H009 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms