Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPESC1Q9GZL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPESC1Q9GZL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms