Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCL11BQ9C0K0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCL11BQ9C0K0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms