Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMES1Q9C002 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms