Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM54Q9BYV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms