Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
SYCP2Q9BX26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYCP2Q9BX26 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYCP2Q9BX26 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYCP2Q9BX26 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms