Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAIPQ9BWF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms