Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIFC3Q9BVG8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIFC3Q9BVG8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms