Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms