Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPS4Q9BT78 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COPS4Q9BT78 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms