Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C2orf88Q9BSF0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms