Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms