Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPNE1Q99829 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPNE1Q99829 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPNE1Q99829 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms