Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP88Q99567 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP88Q99567 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP88Q99567 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms