Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP19Q99542 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP19Q99542 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms