Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM209Q96SK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM209Q96SK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms