Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CICQ96RK0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CICQ96RK0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms