Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC4A9Q96Q91 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms