Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMTK3Q96Q04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMTK3Q96Q04 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LMTK3Q96Q04 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms