Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms