Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM20AQ96MK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM20AQ96MK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms