Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRC1Q96M27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms