Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNPC3Q96LT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNPC3Q96LT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms