Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT74Q96LB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT74Q96LB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms