Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD3Q96L08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms