Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPZA3Q96KX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA3Q96KX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms