Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EAF1Q96JC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EAF1Q96JC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms