Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZBED3Q96IU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED3Q96IU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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