Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTP4Q96DX8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms