Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC11Q96DB2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC11Q96DB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms