Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms