Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3DQ96BQ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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