Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms