Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RFKQ969G6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFKQ969G6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms