Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX4Q969G2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX4Q969G2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms