Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL5Q93034 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL5Q93034 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL5Q93034 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms